拟南芥的生物钟基因网络中包含一个附加的抑制反馈循环

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分子系统生物学，2012年3月6号

生物钟使用互锁的转录反馈环路的分子机制调节生物生理过程，使他们与昼夜循环同步。在最近的实验中发现了作为一个抑制因子的傍晚复合体（EC），它对植物中基因表达节律至关重要。将EC组件集成到现有的模型中，显著地改变了我们的机理性生物钟基因网络的数学模型。EC基因的负自动调节组成了生物钟的傍晚循环，替换了假设的组件Y。EC解释了我们先前的猜想，傍晚基因TIMING OF CAB EXPRESSION1 (TOC1)抑制上午基因PSEUDO-RESPONSE REGULATOR 9(PRR9)。我们的计算分析表明，TOC1是上午基因LATE ELONGATED HYPOCOTYL(LHY) 和 CIRCADIAN CLOCK ASSOCIATED1(CCA1)的抑制因子，而不是先前认为的激活因子。这排除了先前生物钟模型中的未知成分X（TOC1mod）的必要性。该模型可以匹配时序和相位响应数据，为植物生物钟提供了一个新的概念构架，其中包括了生物钟结构的三个抑制反馈环路。

拟南芥生物钟基因调控网络