蓖麻基因组bZIP家族鉴定与表达分析

蓖麻是双子叶胚乳型植物的典型代表，是大戟科中重要的油料作物，其种子油被广泛地应用在工业上。bZIP（basic leucine zipper）转录因子广泛分布于真核生物中，在植物中涉及多种生物进程，其中ABF亚族更是ABA信号途径中重要的调控因子。

分子遗传与育种组研究发现ABA对蓖麻油脂累积具有显著作用，bZIP转录因子可能参与ABA调控蓖麻油脂合成信号途径，为此研究人员在蓖麻全基因组鉴定得到蓖麻bZIP家族所有成员，进一步对蓖麻bZIP家族基因结构、蛋白结构、二聚化特性、进化以及表达谱分析。得到以下结论：蓖麻bZIP家族成员49个，根据保守bZIP结构域特征将bZIP家族分为11个组（Group）；对蓖麻bZIP转录因子结构域外的保守基序（Motif）、基因结构、进化关系等生物信息学分析，初步揭示了这两个家族成员在进化和功能上的相关性；对拟南芥和蓖麻中bZIP成员系统发生分析，均表明二者既存在同源性，又在进化中有基因丢失现象；基于DGE高通量表达测序数据以及公开的蓖麻五个组织RNA-Seq数据分别对蓖麻bZIP基因的组织表达模式分析，得到种子特异性表达的或者潜在与油脂相关的基因。

本研究结果为了解bZIP转录因子的结构和功能提供了重要的信息。同时也为揭示蓖麻bZIP基因与蓖麻生长和发育，尤其是在种子储存物质累积中作用提供线索。相关研究结果以Genomic surveys and expression analysis of bZIP gene family in castor bean (Ricinus communis L.)为题发表在Planta上。