中国科学家绘出首张“甜橙基因组图谱”
发表日期：2012-12-12 06:01PM 阅览次数：
世界农化网，2012-12-07
11月26日，在国家自然科学基金等项目的资助下，华中农业大学邓秀新院士领衔的柑橘团队在国际著名学术刊物《Nature Genetics》在线发表了题为“甜橙基因组图谱”(The draft genome of sweet orange)的研究论文。甜橙基因组的完成将在理论上为柑橘基因功能研究提供框架，也将在应用上为果实品质包括色、香、味等重要性状基因的遗传选育发掘及品种改良提供重要平台。这也是世界上第一例芸香科植物基因组图谱，对柑橘基因及重要农艺性状的解析具有里程碑的作用。
我国是世界上重要的柑橘原生中心，我国栽培柑橘的历史悠久，4000年前已有经济栽培。甜橙品种"伏令夏橙"即可鲜食，同时也是全球最大的加工橙汁品种。华中农业大学的甜橙基因组研究团队对这一甜橙品种采用最先进的全基因组鸟枪测序法(WGS)及远程配对末端标记策略, 拼接组装所获得的基因组序列覆盖率近90%，获得注释的基因约3万个。通过结合遗传标记和染色体原位杂交分析，甜橙基因组序列被进一步整合到已知的9条染色体, 因此完成了对甜橙基因组接近完全的解码和基因定位。
通过对基因组数据的分析，该团队发现甜橙基因组中约有一半的基因处于杂合状态，并有显著的橘和柚的遗传特征，其中橘的遗传成分约占3/4，柚的遗传成分占1/4，据此提出了甜橙起源的新理论，即甜橙来源于柚做为母本和橘杂交，其后代再与橘杂交而形成的杂种。通过基因表达以及基因组比较分析，发现了一个可能在甜橙果实内大量合成维生素C的关键基因。该基因家族的扩增、快速进化、功能分化以及组织特异表达等可能与甜橙果实大量合成维生素C有关。
