西瓜核心种质遗传多样性分析及指纹图谱构建

深入了解西瓜核心种质资源的群体结构及遗传多样性，可以准确指导亲本间杂交组合的有效配置，避免具有相似遗传背景材料的组合，以便提高育种效率。据此，本研究通过采用 45 对具有多态性的 SSR 标记对不同来源的 78 份西瓜核心种质进行了多元统计分析。结果表明，45 个 SSR 标记共检测出 175 个位点，其中具有多态性位点数为 165 个，多态性比率达 95.41%，且每对引物平均检测到等位基因位点 3.67 个，PIC大小范围在 0.049~0.781 之间，平均值为 0.415，其有效等位基因数(Ne)、期望杂合度(He)、观测杂合度(Ho)、多样性指数(I)及 Nei's 基因多样性指数(H)在该群体水平上分别为 2.258、0.479、0.521、0.850 和 0.476，同时筛选出了 28 对多态性高、带型稳定、易于统计的核心引物，构建了 78 份西瓜核心种质的 SSR 指纹图谱。群体结构分析表明，78 份西瓜核心种质资源划分为 2 大类群和 4 个亚群，其中来自不同地域的美国材料和日本材料分别独立趋于 2 大类群中，而中国种质材料普遍交叉分布于 2 大类群中，且各亚群之间存在着明显的基因交流，分子方差分析表明种质间遗传多样性主要存在于品种间和居群间。