基于转录组测序的黑枣 EST-SSR 引物开发与鉴定分析

目前黑枣已有的分子标记比较匮乏，本研究基于转录组测序技术对黑枣品种进行 SSR 引物开发，为黑枣种质资源评价及分子标记辅助育种提供有力的技术支持。本研究对‘冀洪 1 号’黑枣转录组序列进行了分析筛选和开发，并利用开发出的引物进行了验证分析。结果表明：共得到 52 537 个 Unigene 序列，SSR位点总数 22 327 个，包含 SSR 的 Unigene 序列数为 15 286 条。黑枣 SSR 位点的重复单元中，二核苷酸重复类型的 SSR 最多(52.26%)，其次为单核苷酸(25.84%)及三核苷酸(19.25%)。随机挑选 90 对 EST-SSR 引物进行验证，有效扩增率为 77.78% (70 对)，多态性引物比例为 18.57% (13 对)，对 13 个多态性位点进一步分析可得，共扩增了 35 个等位基因，PIC 值介于 0.233~0.677 之间，平均为 0.430。本研究开发出的 EST-SSR 分子标记，为后期进行黑枣良种的鉴别及分子育种提供了分子技术手段。