菠萝蜜 BRI1 家族成员生物信息学的预测与对比
发表日期:2021-01-27 10:33PM 阅览次数:
菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus)是热带地区常见的木本植物之一,具有较高的经济和科研价值。本研究采用已完成菠萝蜜幼苗茎叶的全长转录组测序(PRJNA579273),在此基础上对菠萝蜜(Artocarpus heterophyllus) BR INSENSITIVE 1 (BRI1)家族成员 AhBRI1、AhBRL1 和 AhBRL2 进行生物学信息分析,将基因翻译成蛋白。以菠萝蜜为主,将其与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、川桑(Morus notabilis)和毛果杨(Populus trichocarpa)利用在线分析工具分析得到不同的理化性质数据以及蛋白的二、三级结构。得到不同物种 BRI1蛋白家族之间生物信息学的预测与对比。结果表明,其氨基酸残基数分别为 1 195、1 170 和 985,理论等电点为 6.32、5.77 和 7.08,蛋白呈弱酸性,具有一定亲水性,较为稳定;存在分泌途径信号肽或叶绿体转运肽,具有跨膜结构;二级结构主要元件为无规则卷曲和 琢- 螺旋,三级结构为螺旋管状结构。本研究为进一步对菠萝蜜 BRI1 蛋白家族成员的功能研究提供依据。