甘蓝型油菜热激蛋白 HSP70 基因家族的鉴定和分析

热休克蛋白也称热激蛋白(heat shock protein, HSP)，是植物在受到生长环境中不利的生长因子胁迫时产生的一种用于抗逆的防御蛋白，其中在生物体中分布最普遍的一种热激蛋白是热休克蛋白 70 (heat shock protein 70, HSP70)。为全面、深入地了解芸薹属 HSP70 基因家族的信息，本研究对芸薹属的 3 个物种(白菜, 甘蓝和甘蓝型油菜)进行了生物信息学分析，首先在 BRAD 数据库中对芸薹属的 3 个物种进行 HSP70基因数目的鉴定，分别在白菜和甘蓝中鉴定出了 2 个 HSP70，在甘蓝型油菜中鉴定出了 4 个 HSP70。将鉴定出来的这 8 个 HSP70 基因进行生物信息学分析(系统发生关系, 基因结构, 保守基序, 染色体定位和同源性等)，结果显示，芸薹属 HSP70 基因结构相似，在核酸和蛋白水平均具有高度保守性，进化过程中基本种之间以及天然杂交种与基本种之间均保持着极高的同源性，进化树以及其他生物信息学分析结果还表明甘蓝型油菜的 HSP70 位点与白菜、甘蓝的 HSP70 位点符合“禹氏三角”理论，但是根据 3 个物种的 HSP70 基因数量及对应关系等分析结果可推测白菜、甘蓝、甘蓝型油菜 3 个物种的 HSP70 位点与三倍化理论不完全一致，此结果可反映芸薹属的这 3 个物种在进化过程中其 HSP70 基因在数量或结构上发生过变化，致使其不满足三倍化学说。