马尾松候选基因 EST-SSR 引物开发

松脂产量是马尾松的重要经济性状,通过开展候选基因关联分析获得与产脂性状具有较强相关性的遗传标记,进行分子标记辅助选择,是加快马尾松产脂性状改良进程的一种可行方法。该研究通过对马尾松高产脂无性系与普通产脂无性系的针叶、顶芽和韧皮部 3 个组织进行转录组差异分析,并根据所得差异序列开发 SSR 引物,为马尾松产脂性状候选基因关联分析研究提供分子标记。经分析共在 6 个样本的 124 345条Unigene 序列中发现 14 461 个 SSR 位点。根据表达差异基因序列含有 SSR 的位点设计开发了 259 对EST-SSR 引物,其中 147 对引物可扩增出清晰条带,引物的有效性为 56.76%;有 65 对引物表现出多态性,多态率为 25.10%,可用于进行马尾松产脂性状候选基因关联分析。本研究所开发的 EST-SSR 引物为今后马尾松的关联分析研究、分子标记辅助育种研究等提供可靠的标记,并为马尾松产脂性状关键基因的挖掘提供参考依据。

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