紫花苜蓿MsGT6的生物信息学及其逆境胁迫下表达分析

GT6 基因属于 Trihelix 转录因子家族,该家族在调节植物生长发育及应答逆境胁迫等方面发挥着重要作用。为了明确紫花苜蓿 Trihelix 家族成员的基本特征及其在逆境胁迫下的响应,本研究利用生物信息学方法从蒺藜苜蓿数据库中鉴定出 41 个 Trihelix 成员,并对其进行染色体定位、系统进化树和保守基序分析。结果表明,Trihelix 家族成员不均匀分布在 8 条染色体上,其中 MtGT6 定位在 1 号染色体上,其分子量为 64.373 kD,等电点为 5.895,属于亲水性蛋白;亚细胞定位预测显示该基因位于细胞核;对 MtGT6 启动子顺式作用元件分析,发现启动子区域存在多种顺式作用元件,推测其能在多种逆境中响应;qRT-PCR 分析表明,该基因对盐碱响应更为明显。

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