马铃薯耐盐品种的鉴定及 StDWF4 基因生物信息学分析
发表日期:2021-01-02 10:40PM 阅览次数:
随着土壤盐碱化面积的扩大,作为第四大主粮作物的马铃薯耐盐品种的选育和耐盐机理的研究尤为重要。本试验以六个马铃薯组培苗品种为材料,研究在不同 NaCl 浓度下生理特性的变化。结果表明,随着NaCl 浓度升高,‘尤金 885’的叶绿素 A、B 及类胡萝卜素含量降低幅度最小,丙二醛(MDA)含量增长最迅速,过氧化氢酶(CAT)和超氧化物歧化酶(SOD)活性最强。利用 NCBI 数据库进行比对,筛选到耐盐基因 StDWF4,并对其进行生物信息学分析。结果表明,StDWF4 基因编码 1 476 个氨基酸,等电点为 5.04,是一种含信号肽的亲水性、分泌型蛋白。二级结构分析显示,该蛋白含有 α 螺旋 169 处,占总二级结构的 34.42%;延伸链 104 处,占 21.18%;无规则卷曲 218 处,占 44.40%。同源性比对及系统进化树分析表明,StDWF4 基因编码的氨基酸序列与番茄 cytochrome P450 90B3 耐盐基因亲缘关系为最近。本研究结果表明,‘尤金 885’的耐盐性最强,为今后耐盐品种的选育提供良好材料;生物信息学分析表明,StDWF4 基因具有耐盐基因的典型特征,为马铃薯耐盐品种的分子鉴定提供理论指导。