波罗蜜叶绿素缺失突变体次生生长茎抗病基因的筛选

为研究波罗蜜叶绿素缺失突变体(chlorophyll deficient mutant, CDM)次生生长茎中抗病基因(plant resistant genes, PRGs)的变化，从转录组数据中筛选出9 630个PRGs。去除低丰度(FPKM≤0.5)后进行差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)筛选，将2 513个DEGs进行加权基因共表达网络分析(weighted gene coexpression network analysis, WGCNA)，寻找到2个与表型关联性较高的模块，共183个DEGs。对模块基因进行GO功能注释、分类、转录因子(transcription factors, TFs)及类受体蛋白激酶(receptor-like kinases, RLKs)分析。结果显示，模块基因主要注释在结合(Binding)、催化活性(Catalytic activity)和代谢过程(Metabolic process)等功能组。TFs分析显示，共有7个家族，14个转录因子。RLKs分析发现，RLK-Pelle-DLSV亚家族的12个DEGs中有11个在CDM中上调表达，说明该亚家族在波罗蜜CDM次生生长茎抵御逆境侵害过程中发挥着重要作用。本研究运用转录组测序数据分析波罗蜜CDM次生生长茎中PRGs的变化，为光合作用对木本植物茎响应逆境胁迫的研究提供数据。