胀果甘草中NAC转录因子基因鉴定及盐胁迫下差异表达分析
发表日期:2020-12-10 10:33PM 阅览次数:
摘 要 NAC转录因子广泛作用于植物的生长发育的各个阶段,具有应对逆境胁迫的作用。本文利用生物信息学方法从胀果甘草愈伤组织转录组中鉴定出86个胀果甘草NAC转录因子基因和14个NAC差异表达基因,将14个差异表达基因命名为GiNAC01-GiNAC14。系统进化树聚类分析结果表明,胀果甘草愈伤组织转录组中的NAC家族基因被分为13个小组,14种NAC差异表达基因主要聚集在第5小组和第13小组。胀果甘草NAC差异表达基因与拟南芥NAC家族基因蛋白质构建的进化树聚类为11个组,其中差异表达基因主要聚集在第1小组和第4小组。序列分析结果表明胀果甘草NAC差异表达基因推定蛋白质氨基酸组成中富含丝氨酸和酸性氨基酸,脂肪族氨基酸占比较大;蛋白质二级结构主要组成元件是无规则卷曲,亚细胞定位多数定位于细胞核;蛋白质大多无跨膜螺旋和二硫桥结构,无信号肽结构,多为亲水性蛋白质。本次的研究丰富和完善了胀果甘草NAC基因的探索,为进一步研究胀果甘草NAC基因响应逆境胁迫的分子机制及功能奠定了基础。