棉花愈伤组织诱导与形成的转录组分析

为探讨棉花体下胚轴诱导形成非胚性愈伤组织的分子机理，本研究以陆地棉 YZ1 为材料，采用RNA-seq 技术分析棉花下胚轴诱导形成非胚性愈伤组织过程中的基因表达情况。与棉花下胚轴相比，诱导培养 45 d 的非胚性愈伤组织中差异表达基因有 21 373 个(上调基因 10 628 个, 下调基因 10 755 个)。GO 功能富集分析表明，棉花下胚轴与非胚性愈伤组织间差异表达基因的功能主要富集到涉及细胞分裂与形成的相关过程，如 MCM 复合体、涉及 DNA 复制的 DNA 解旋、DNA 复制起始、驱动蛋白复合体、基于微管的运动、早前期带、微管运动活性、植物型细胞壁等。KEGG 富集分析结果显示，棉花下胚轴与非胚性愈伤组织间差异表达基因主要参与鞘糖脂生物合成 - 神经节系列、糖胺聚糖降解、油菜素内酯、有机含硒化合物代谢、丙氨酸- 天冬氨酸 - 谷氨酸代谢等代谢通路。本研究为棉花非胚性愈伤组织的基因表达提供了全面的数据，为进一步开展棉花愈伤组织诱导与形成的功能研究提供了重要的资源。