薰衣草SRAP-PCR反应体系的建立及优化

为建立可靠并且稳定的 SRAP-PCR反应体系,进一步开展新疆薰衣草种质资源的遗传多样性研究提供帮助。本研究采用 L16(45)正交试验设计方法,对薰衣草 SRAP-PCR反应体系主要影响因素 DNA模板、Mg2+、dNTPs、引物浓度及Taq DNA聚合酶的用量进行了筛选,比较了 5个因素对扩增效果的影响。试验结果表明,各因素水平变化对反应体系的影响从大到小依次为:Mg2+>引物>Tap 聚合酶>dNTPs>DNA;建立的最佳反应体系为:总体积 25.0 μL,2.5 μL 10×Buffer、Mg2+浓度 3.0 mmol/L、d NTPs浓度 0.32 mmol/L、引物浓度0.24 μmol/L、DNA模板量 60 ng、Taq DNA聚合酶用量 0.4 U,该体系经验证可以扩增出清晰、稳定且多态性较好的条带,可为开展后续的研究提供技术基础。

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