基于SLAF-Seq技术的广金钱草SNPs标记开发及遗传分析

为分析不同来源广金钱草的遗传关系，本研究利用 SLAF-seq 技术对来自广东、广西、海南的 20 份广金钱草样品进行测序，共获得 SLAF 标签 322 360 个，鉴定到 72 395 个多态性 SLAF 标签。进行过滤后开发得到 SNP 多态标记 220 704 个，分析得到 94 505 个高一致性的群体 SNP。通过对 20 份不同来源的广金钱草个体完成系统进化树、群体结构分析，结果表明，20 份广金钱草来源于同一祖先，但由于地理隔离的影响使得个体间发生了遗传分化。通过系统进化树分析发现分布在广东、广西及海南琼中、屯昌的广金钱草具有较近的亲缘关系。研究结果为种质保护和遗传改良提供参考。