基于RNA-Seq技术的乒乓菊转录组分析

为开展乒乓菊基因功能分析、表型差异、分子标记开发和遗传多样性等研究，本试验以‘绿乒乓’和‘粉乒乓’的花朵和叶片混合样品为试验材料，通过转录组测序分析，经 de novo 组装后获得 133 200 条Unigenes，进一步利用 6 大公共数据库对其进行注释，共注释 64 601 条 Unigenes，并基于转录组数据开展SSR 和 SNP 位点预测。结果表明：有 25 462 条 Unigenes参与了 KEGG 代谢通路，包括与花色、花期和药用成分代谢等相关的途径；共预测到 1 444 个转录因子，分属于 35 个家族，包括在植物的生长发育、生物合成、抗非生物和生物胁迫等方面发挥重要作用的 AP2/ERF、C2C2、bHLH、WRKY 等转录因子家族，以及 LBD、MADS 和 TCP 等与花色素苷代谢、花和根系发育、植物进化和发育密切相关的转录因子家族。此外，从13 014 条 Unigenes序列中搜索到 14 905 个 SSR 位点；并分别从‘绿乒乓’和‘粉乒乓’中挖掘到 1 081 925 个和 1 077 818 个 SNP 位点。本研究可为乒乓菊功能基因挖掘和分子标记开发提供基础。