菜心光敏色素B基因BcPHYB的鉴定与分析

菜心在长日照或短日照条件下均可抽薹开花，为解释菜心开花对光周期不敏感的分子机制，本研究以‘四九菜心’为材料，利用菜心叶片转录组测序数据鉴定了光敏色素 B 基因(BcPHYB)。通过构建系统树，发现菜心 BcPHYB 类似于早花大白菜 BraPHYB2，并且在 5’UTR 中存在 20 bp 的 InDel。菜心 BcPHYB 在pre-mRNA 加工中存在着选择性剪接，一部分转录本会保留 1 号、2 号或 3 号内含子，导致相应的 BcPHYB蛋白产物中插入或者缺失部分氨基酸序列片段。本研究分析了菜心 BcPHYB 的 InDel 变异与选择性剪接情况，为阐释菜心对光周期不敏感的开花分子机制提供了帮助。