烟草bZIP基因家族的鉴定及其A亚族在ABA处理下的表达分析

为鉴定烟草中 bZIP 转录因子并验证其部分基因在非生物胁迫诱导中的响应机制，本研究基于最新的烟草基因组测序结果对 bZIP 基因家族进行了全基因组鉴定及生物信息学分析，并在 ABA 处理下对其A 亚族的 18 个基因进行了转录水平检测。结果表明，利用基于隐马尔可夫模型的 Hmmer 软件和 Pfam的在线蛋白结构预测，在烟草全基因中总共鉴定得到 105 个包含 bZIP 保守结构域的基因，其蛋白序列长度分布为 112~973，蛋白分子量分布为 12 913.63~104 640.38 Da，保守结构域序列长度在 35~59，等电点分布在4.91~9.79，都属于亲水蛋白。对获得的全部烟草 bzip 家族序列构建系统进化树，以拟南芥的 71 个 bZIP 序列为对照，将其划分为 10 个亚族，即 A~I 和 S。通过 MEME 在线软件预测出烟草 bZIP 基因家族有 20 个模体结构，其中 motif 1 普遍存在于 103 个蛋白之中，每一个亚族中模体的种类和数目都是相似的，说明了亚族分组的可靠性。通过对普通烟草在 ABA 处理下 bZIP 基因家族中的 A 亚族基因的转录水平表达模式分析表明，18 个基因受到诱导表达，表达量均出现上调，但最大值出现的时间不同，说明 bZIP A 亚族基因应对ABA 处理时具有一定的共性，但是具体的响应模式不同 。