石榴种质资源的matK基因序列分析

本研究以 60 个石榴品种为材料，PCR 扩增获得石榴品种的 matK 基因片段，分析石榴资源的 matK基因序列的碱基组成、序列间碱基变异频率和转换/颠换比率；计算品种间遗传距离(K-2P)，构建遗传关系分类图，研究 matK 基因序列对石榴品种鉴定的效果。结果表明，石榴物种的matK 基因片段容易获得，PCR 扩增成功率为 98.3%，测序成功率为 100%，59 个石榴品种 matK 基因片段最长为 897 bp，最短为 820 bp。石榴的 matK 序列保守性为 95.8%，G+C 含量相对稳定，平均含量33.3%，A+T平均含量高达 66.7%，密码子偏好 A 和 T；序列碱基存在转换/颠换比率为1.003，核苷酸多样性为0.000 8，每位点核苷酸多态性指数Theta值为 0.000 54。K-2P 遗传距离在0.000~0.024 之间，平均遗传距离为 0.007，邻接法(NJ)构建 59 个品种遗传关系聚类图，59 个品种被分为 6 大类，分类结果与形态学和品种地理来源分类没有明显相关性。