水稻无侧根突变体RM109及其野生型对照的转录组分析

侧根是水稻根系的重要组成部分，具有重要的意义。本研究通过 Illumina Hiseq2000 测序平台，对无侧根突变体 RM109 与其野生型对照根系进行转录组测序，进而比较分析差异表达基因，初步揭示影响水稻侧根发育的相关基因。结果表明无侧根突变体与野生型对照根系相比出现了 2 327 个差异基因，其中上调表达的有 1 131 个，下调表达的有 1 196 个，有 36 个基因表达差异倍数高达 100 倍以上(|log2Ratio|≥6.7)。通过Gene ontology (GO)数据库、KEGG pathway 数据库比对分析注释差异表达基因的功能和参与的分子调控途径。GO 分析结果表明被注释的差异基因划分成 50 个功能类别，KEGG 分析共有 352 个显著差异基因可以详细注释到 149 条分类代谢途径中，共有 36 个表达差异基因富集于植物激素信号转导途径，36 个差异表达基因中有 2 个是与植物根系生长发育相关的 A ux/IA A 基因，6 个植物生长素响应 SAUR 基因。本研究为进一步为水稻侧根发育分子机理研究提供基础，为水稻根系育种提供理论参考。