橡胶草SRPP5 基因的克隆及生物信息学分析

天然橡胶是产胶植物中合成的聚异戊二烯高分子化合物,而小橡胶粒子蛋白是橡胶粒子膜上参与天然橡胶分子链延伸的关键因子,与橡胶的产量和质量密切相关。本研究利用 PCR技术从橡胶草中克隆得到TkSRPP5 基因全长序列并进行生物信息学分析。结果表明,该基因含有一个长度为 654 bp的开放阅读框,并编码 217个氨基酸,所编码蛋白的分子量为 23.31 kD,理论等电点为 4.58。TkSRPP5为亲水性蛋白,具有 24个磷酸化位点,亚细胞定位预测在细胞质中。该蛋白属于 SRPP家族,二级结构主要存在琢- 螺旋和无规则卷曲结构,与预测的蛋白质三级结构一致。系统进化树分析表明,该蛋白与菊苣的 SRPP蛋白有着最近的亲缘关系。本研究为进一步了解TkSRPP5 基因的功能和其在橡胶草胶乳合成中的作用机制提供了理论依据。

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