白菜 S- 腺苷甲硫氨酸脱羧酶 BrSAMDC 基因的克隆、表达及生物信息 学分析

S- 腺苷甲硫氨酸脱羧酶(S-adenosylmethionine decarboxylase, SAMDC)是生物体内亚精胺合成过程中的限速酶，在植物生长发育及抗逆境胁迫方面起到重要的调节作用。本研究通过 RT-PCR 技术从大白菜栽培种 Chiifu-401 中克隆得到一个 BrSAMDC 基因，并对其进行表达特性及其蛋白的结构与功能进行生物信息学分析。结果表明，BrSAMDC 的 cDNA 扩增序列为 1 566 bp，CDS 区为 1 107 bp，编码 368 个氨基酸。定量PCR 结果显示，BrSAMDC 基因在白菜的各个组织均有较高表达，其中角果中的表达量最高，其次为花、茎和根，而在叶片中的表达量最低。BrSAMDC 蛋白分子量为 40.52 kD，属于亲水、稳定蛋白；预测其分布于细胞核内，不存在信号肽和跨膜结构域；二级结构中以无规则卷曲和 α- 螺旋为主，三级结构同源建模成功。14 种植物 SAMDC 蛋白的序列对比分析显示，均含有 LSESSLF 结构域和 PEST 结构域，且十分保守；十字花科的 SAMDC 蛋白同源性较高，且其氨基酸的进化与植物分化具有一致性。本研究为白菜 SAMDC 基因的功能研究及应用提供数据基础。