油棕植物激素相关基因的生物信息学分析

油棕(Elaeis guineensis Jacq.)享有“世界油王”的称誉，油棕中果皮的棕榈油(Palm oil)含量非常丰富，占干重的 80%。众所周知，赤霉素(gibberellins, GAs)、生长素(Auxin)和乙烯(Ethane)是分布较广的植物激素，参与多种植物的油脂代谢和脂肪酸积累过程，且这 3 种激合成相关基因素在油棕中的研究鲜有报道。基于前期对非洲油棕果壳转录组基础上，本研究针对油棕赤霉素相关基因 EgGA20ox 1-D 和 EgGA20ox 2，生长素相关基因 EgYUC1 和乙烯相关基因 EgACS，进行生物信息学分析及生物学功能预测。结果发现，EgGA20ox 1-D、EgGA20ox 2、EgYUC1 和 EgACS 蛋白均为疏水性蛋白，且具有多个功能位点(糖基化位点和磷酸化位点)。除了 EgYUC1 蛋白有 2 个跨膜结构区外，其余无跨膜结构区。此外，这四类蛋白二级结构的主要元件为无规则卷曲和 α 螺旋。该研究结果对深入解析油棕这 3 类植物激素相关基因在油脂代谢中的功能及其调控机理提供科学参考。