基于转录组测序的苦瓜热激蛋白相关基因分析
发表日期:2020-05-28 09:35PM 阅览次数:
为获得苦瓜叶片高温胁迫状态下表达的相关基因,本研究以高温胁迫下苦瓜叶片为实验材料,采用 Illumina HiSeq 2500 高通量测序技术对正常温度(26℃)和高温胁迫(38℃)下苦瓜叶片转录测序后进行组装,再利用 KEGG、Pfam、Swiss-Prot 和 NR 数据库平台对热激蛋白的相关功能基因筛选,共获得 24 个热激蛋白相关基因,包括得 20 个热激蛋白基因、2 个位于叶绿体中的小热激蛋白以及 2 个热激转录因子。聚类分析研究表明,涉及到热激蛋白相关的 20 个 Unigene 广泛分布于 3 大类中,其中 c42567 和 c43094 这两个亲缘关系最近;两个小热激蛋白 c42963 和 c12133 的亲缘关系次之;c35683 和 c3040 两个热激转录因子亲缘关系最远。通过本次研究中获取的 24 个热激蛋白相关 Unigene 信息,有助于深入研究苦瓜耐高温胁迫机理等提供数据信息。