亚麻(Linum usitatissimum)铅胁迫转录组初步分析
发表日期:2020-05-28 09:35PM 阅览次数:
亚麻的不同器官具有多种商业价值。随着土壤重金属污染情况日益加剧,有必要对亚麻响应重金属污染的分子机理进行研究。本研究采用二代测序技术,对亚麻在铅胁迫下地上部位样品进行转录组分析。通过对原始测序数据进行质量控制,并利用 HISAT 软件等对处理后数据拼接到亚麻参考基因组,获得了高质量 Unigenes 和拼接结果。对 Unigenes 进行序列比对、功能注释和分类、序列变异分析。结果显示,本次测序结果共获得 43 471 条 Unigene,并且这些 Unigenes 的大部分(89.6%)都完全比对到参考基因组的预测外显子区域。对测序结果的 KOG 和 KEGG 分析结果表明亚麻在铅胁迫条件下可能影响的通路信息。最后,对测序结果进行转录因子预测和序列变异分析,为后续针对亚麻响应重金属胁迫的相关研究提供了候选分子资源。