水稻抗坏血酸氧化酶基因家族生物信息学分析

抗坏血酸氧化酶(ascorbic acid oxidase, AAO)是多铜氧化酶家族中的一员，在植物生长发育过程中起重要作用。为深入研究水稻 AAO 基因家族的功能特征及表达模式，采用生物信息学从 Phytozome 的水稻数据库鉴定出 14 个 AAO 成员，并对其染色体定位、蛋白理化性质及二级结构、基因结构、保守基序、系统发
生树和表达模式等方面进行预测分析。结果显示，14 个 OsAAO 不均匀地分布在 8 条染色体上，多为碱性蛋白；蛋白二级结构以无规则卷曲为主要组成部分；基因结构和保守基序分析表明，OsAAO 内含子数目变化差异较大，但氨基酸序列具有较强的保守性；系统发生树可分为 3 个亚家族，OsAAOs 与玉米、高粱簇在一起，亲缘关系较近；另外表达模式分析发现，OsAAO 在不同的组织部位表达水平具有差异，这表明其行使功能不同。这些结果为今后研究该基因家族的生物学功能和培育耐旱品种提供理论依据。