筛选金线莲种质资源的通用 DNA 条形码序列及鉴定其混伪品
发表日期:2019-09-07 09:31PM 阅览次数:
本研究对 32 份金线莲(Anectochilus roxburhii)种质资源的四个 DNA 条形码(ITS, rbcL, psbA-trnH, matK)基因进行 PCR 扩增及测序,从基因库下载了金线莲及其 3 种主要混伪品的 29 条序列,分析比较各序列的差异位点、信息位点、GC 含量等,并进行种内和种间的遗传距离计算,构建基于 K2P 模型的 NJ 系统发育树,综合比较不同序列的鉴定能力,最终从四个 DNA 条形码候选序列中筛选出可用于金线莲资源鉴定的通用序列。结果显示,ITS 和 psbA-trnH 基因序列的种内、种间的变异位点差异和遗传距离差异较大,相比rbcL 和 matK 序列具有显著优势,且 ITS 基因不仅能够快速而准确区分金线莲及其混伪品,而且能够在种内水平上区分金线莲的不同品种。因此,ITS 基因序列是较适合鉴别金线莲资源的理想条形码。所得结论与前人关于金线莲的有效成分的研究结果进行了关联,发现不同品系的金线莲所含有效成分差异较大。因此,本研究可以为金线莲的功能产品研发、优良品种选育、药理药效研究等方面提供帮助,尤其在金线莲资源选择上提供了较为理想的方法,研究具有一定的应用前景和科学价值。