上饶早梨全基因组重测序和转录组的关联分析

本研究对上饶早梨两种品种‘花厅六月雪’(BR)和‘花厅黄皮消’(HR)的全基因组重测序和转录组进行关联分析。结果表明:在进行差异 InDel 分析后,共有 3 682 个候选基因与转录组数据进行了关联分析;在CV 分析后,共有 2 067 个候选基因与转录组数据进行了关联分析;在进行 CNV 分析后,与转录组差异基因数据进行了关联分析,其中分类为 amplification 的 CNV 中,属于显著差异的,并且倍性变化逸2 倍的 CNV,BR相对于 HR 有 79 个上调,42 个下调;分类为 deletion 的 CNV 中,属于显著差异的,并且倍性变化逸2 倍的CNV,BR 相对于 HR 有 149 个上调,193 个下调;分类为 neutral 的 CNV 中,属于显著差异的,并且倍性变化逸2 倍的 CNV,BR 相对于 HR 有 199 个上调,196 个下调。本试验结果可为上饶早梨两种品种‘花厅六月雪’(BR)和‘花厅黄皮消’(HR)的品种鉴定和品种选育提供理论依据。

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