金冕草盐胁迫转录组差异性分析

为揭示金冕草在盐胁迫处理下基因表达谱的变化，在缺乏参考基因组的情况下采用高通量Illumina HiseqTM 4000 测序技术对金冕草进行转录组测序，并对测序数据进行分析，探究金冕草响应盐胁迫的适应机制。结果表明：盐胁迫 24 h 上调和下调的 DEGs (Differential-expressed genes)分别有 6 707 个和1 972 个；48 h 分别有 8 652 个和 1 747 个。在 GO 富集分析中，差异基因主要存在于细胞成分、生物进程、结合和催化活性中。KEGG 分析结果表明，差异基因主要参与核糖体、植物激素信号转导、氨基酸生物合成等代谢途径。通过 GO 和 KEGG 显著性富集分析得知，NaCl 胁迫下差异表达上调的基因数明显多于下调的基因表达数。qRT-PCR 验证了 DEGs 的表达趋势与 RNA-Sep 测序分析结果一致，证明了 RNA-Sep 结果的准确性。本研究为金冕草耐盐分子机制研究提供了参考依据。