基于RNA-Seq SSR标记的沙棘种质遗传多样性和群体遗传结构分析

沙棘是中国重要的生态经济植物，遗传多样性分析对于其种质资源的评价与保存十分重要。现以80 个沙棘品种/品系为试材，利用 17 对多态性的 RNA-Seq SSR 引物，研究其遗传多样性和群体遗传结构。17 对 SSR 引物共扩增出 50 条谱带，其中多态性谱带 41 条，每个位点条带数在 2~5 之间；多样性指数(PIC)介于 0.150 7~0.588 6，平均 0.271 0。利用 PowerMarker 3.25 和 UPGMA 方法进行聚类分析。结果显示，供试材料可分为两大类群，蒙古沙棘(ssp. mongolica)和杂交品种/品系聚为一个类群，中国沙棘(ssp. sinensis)构成另外一个类群。群体遗传结构分析中所有种质也被分成两个类群，杂交品种/品系介于中国沙棘和蒙古沙棘之间，与中国沙棘聚为一个类群。这些结果表明，沙棘的遗传多样性与它们的来源和遗传背景相符，可为沙棘种质资源保存和分子标记辅助育种提供理论依据。