番茄生长素响应因子基因家族的鉴定和生物信息学分析

ARFs (auxin response factors)是植物生长素信号感知和信号传导途径非常关键的转录因子，在植物发育、生物、非生物胁迫和生长趋向性的响应等方面起到极端重要的作用。对番茄全基因组 ARFs 基因家族成员进行筛选、鉴定和生物信息学分析，具有极其重要的意义。番茄基因组中共有 22 个 ARFs 基因。9 个番茄 ARFs 基因由 600~700 个氨基酸编码，是番茄 ARFs 基因大小比较集中的区间。72.7% (16/22)的番茄 ARFs基因等电点小于 7，在 pH 5.39~6.84 的区间内。绝大多数番茄 ARFs 基因结构较为复杂，有数十个内含子。不过有一个番茄 ARFs 进化分枝，内含子较少。番茄和拟南芥 ARFs 全部基因的系统进化分析表明，番茄缺少拟南芥 1 号染色体上 7 个 ARFs 基因组成的一个进化分枝。番茄 ARFs 基因表达表现出显著的组织特异性和随发育阶段的变化。