小麦NIP蛋白的生物信息学分析

本研究通过生物信息学手段，鉴定了两条新的小麦NIP蛋白，并和两条已知的小麦NIP蛋白一起，进行了蛋白质氨基酸序列比对、基序、二级结构、跨膜结构以及亚细胞定位等相关分析。发现两条新的小麦NIP蛋白TaNIP1-2、TaNIP4-1，与已知的TaNIP2-1-LIKE、TaNIP2-2一样，均为脂溶性蛋白，且都具有6个跨膜结构域、N-末端和C-末端位于膜内等MIP蛋白结构共性。亚细胞定位分析结果表明，除TaNIP4-1定位于质膜外，其他三个小麦NIP蛋白均定位于内质网。Motif分析结果显示，除都含有MIP基序外，TaNIP1-2还含有BCHF基序和DUF2157基序。磷酸化位点预测分析结果显示，四个小麦NIP蛋白都未预测到磷酸化位点。所得结果可为小麦NIP蛋白亚家族的研究和利用提供理论参考及分析依据。