基于转录组数据对陆地棉GhHMP1的克隆及表达分析

本研究就转录组数据分析得到一个与镉胁迫相关的基因GhHMP1 (Heavy metal transport/detoxifica- tion superfamily protein1)，并从陆地棉耐镉品种‘邯 242’中克隆成功。为研究该基因的功能和特点，对其进行生物信息学分析、转录组分析和实时荧光定量表达分析。结果表明：陆地棉‘邯 242’基因 GhHMP1的 CDS全长为 402 bp，编码 133 个氨基酸，分子量约为 14.88 kD，等电点为 8.20；转录组和实时荧光定量分析表明，GhHMP1基因的表达具有组织特异性，且受镉胁迫诱导，可以作为重要的候选基因来培育棉花耐镉新材料，从而为棉花耐镉育种及修复重金属污染土壤提供重要的理论依据。