甘蓝型油菜种子发育灌浆后期的转录组分析

油菜种子发育是产量和品质形成的关键发育阶段，包含了复杂的发育过程和调控网络，有效地解析种子发育的转录调控机制具有重要的意义。以甘蓝型春油菜品种青杂 5 号为研究材料，利用 RNA-seq 技术对种子发育的后期(30-DAF, 40-DAF) 2 个发育时间进行转录组测序，筛选差异基因，并利用 GO 数据库和 KEGG数据库注释差异基因功能和可能参与的调控途径。结果表明，从油菜种子灌浆后期的 2 个时间点的转录组中分别检测到 70 850 和 65 193 个表达基因，筛选得到 2 654 个差异表达基因，其中 1 941 个基因下调表达，713 个基因上调表达，29 个基因表达差异倍数 |log2 Ratio|逸10。GO 基因功能分析显示，生物学途径中富集最显著的条目是染色质组装相关的等生物学过程，分子功能方面富集最显著的条目依次是蛋白质代谢、营养库活性等功能类别，而在细胞组件方面富集最显著的条目是染色体相关的等细胞组件。Pathway 显著性富集分析显示注释基因最多的途径是次生代谢途径，其次是淀粉、蔗糖代谢途径、苯丙素生物合成途径中的、碳代谢途径和氨基酸生物合成途径。甘蓝型油菜种子发育后期的转录组分析表明，种子发育 30-DAF 时期次生代谢物、脂质代谢等表达活跃，40-DAF 时期逐渐转变为蛋白质、氨基酸生物合成、光合碳代谢、碳代谢等表达活跃，提示油菜种子灌浆后期仍处于复杂的物质与能量代谢调控过程。