枣 WRKY 转录因子家族的生物信息学分析

明确枣 WRKY 转录因子家族生物学特征,为深入研究枣 WRKY 家族基因的功能提供科学依据。通过 DNAMAN6、MEGA5、Mapdarw 和 MEME Suite 4.12.0 等软件对枣 WRKY 转录因子的数目、基因分类、染色体定位、系统进化关系和保守基序进行了分析。结果表明:枣中包含 92 个 WRKY 基因,根据 WRKY 结构域数量及其锌指结构的特征可将其分为 Group 玉、Group 域和 Group 芋,Group 域又可分为域 a、域 b、域 c、域 d和域 e 5 个亚组。枣 12 条假染色体上除了第 7 条染色体上没有查到枣 WRKY 基因分布外,其它 11 条染色体都有 WRKY 基因分布,其中第 11 条染色体上分布最多,有 10 个 WRKY 基因,第 2 条、第 5 条和第 8 条染色体分布最少,仅有 2 个 WRKY 基因。枣芋、域 d 和域 e 处在同一分支,玉、域 a、域 b 和域 c 在同一分支。枣 WRKY转录因子在同一类或亚类中含有相同的保守 Motif,Motif 最长为 50,最短为 21。枣 WRKY 转录因子蛋白在67~758 个氨基酸范围之间,平均氨基酸个数为 384,等电点为 4.130 8~10.221 1 不等。本研究对进一步探究枣
WRKY 基因的功能、进化以及分子育种具有重要的现实意义。

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