甜瓜 SSR 标记在葫芦科不同作物间的通用性分析

微卫星标记(SSR)在近缘物种间具有通用性,因其高效率、低成本可广泛用于跨物种间的遗传多样性分析、基因定位和图谱构建等。本试验基于甜瓜基因组测序结果开发了 120 对 SSR 标记,研究其在 8 种葫芦科作物间的通用性及作物内的多态性,并利用 NTSYS 软件分析 37 份不同瓜类作物材料间的遗传多样性。结果显示,114 对标记均在甜瓜基因组中得到有效扩增,黄瓜中有 108 对标记有效扩增,通用性比率为94.7%,南瓜中能有效扩增标记最少,其通用性比率也达到了 41.2%,在 8 种葫芦科作物间均通用的标记有29 对;通过对通用性标记的多态性分析表明,甜瓜多态性比率最高为 61.4%,西瓜、黄瓜、苦瓜、冬瓜、西葫芦、南瓜和丝瓜多态性比率分别为 32.5%、14%、4.4%、8.8%、3.5%、13.2%和 11.4%;不同作物间的平均遗传相似系数在 0.70~0.83 之间,其中甜瓜和黄瓜平均遗传相似系数较小,亲缘关系较近,西葫芦和南瓜间的平均遗传相似系数最小,亲缘关系最近。这些通用性标记将有利于提高葫芦科作物整体分子生物学研究水平。

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