菜豆SBP-box基因家族的分子特征与进化分析
发表日期:2018-08-02 09:30PM 阅览次数:
SBP 蛋白是植物特有转录因子,参与众多生物学过程。尽管在许多植物中 SBP 家族基因已经被鉴定,但在菜豆中仍然未见报道。本研究为探索菜豆 SBP-box 基因家族,基于生物信息学手段充分挖掘菜豆基因组和转录组数据资源,鉴定出 23 个菜豆 SBP 基因,并系统分析了这些 SBP 基因的结构、定位、保守基序、表达和系统进化关系。结果表明:23 个基因被分为 2 个大类群,散落分布在 10 条染色体上;菜豆、拟南芥和水稻 SBP 蛋白共存在 16 种类型保守基序组成类型;菜豆 SBP 基因结构种类有 5 种,其外显子数目分别为2、3、4、9 和 10 个;基于 RNA-seq 测序数据的表达分析表明菜豆 SBP 基因表达具有高度多样化特征,这说明参与许多生物学过程。本研究为菜豆 SBP 基因功能研究提供重要线索。