苎麻 BnMAN1 基因及其启动子的克隆分析

甘露聚糖酶基因在植物种子萌发、果实的成熟软化、植物器官的脱落以及非生物胁迫等过程发挥重要作用。为研究其在苎麻中的基因功能，本研究根据苎麻转录组测序中的 BnMAN1 片段序列，克隆该基因的cDNA 全长及其上游的调控序列。生物信息学分析发现：BnMAN1 基因上游的调控序列包括 TATA-box、CAAT-box、AE-box、Box 4、I-box、GAG-motif、GATAmotif、Skn1_motif、ARE、AuxRR-core、TCA-element、MBS 等顺式作用元件。BnMAN1 基因开放阅读框为 1 128 bp，编码 375 个氨基酸，预测其相对分子质量为42.47 kD，理论等电点为 9.45。与树(ABV32548)、苦瓜(XP_022132624)、毛果杨(XP_006383170)、野生大豆(KHN36084)、橡胶树(XP_021678603)氨基酸序列相似性分别为82%、81%、79%、79%、76%。蛋白的二级结构中 琢- 螺旋约占 45.33%，延伸链约为 15.20%，无规则卷曲约为 39.47%。结构域分析发现具有COG3934、Cellulase 结构域，属于 茁- 甘露聚糖酶类。苎麻 BnMAN1 及其启动子将为今后对该基因在苎麻中的功能研究提供帮助。