贵州地方水稻品种抗稻瘟病基因 Pita 功能区段序列变异分析

为了揭示贵州水稻地方品种 Pita 基因序列变异类型和地理分布特点,以贵州省收集到的 91 份地方水稻品种为供试材料,设计抗稻瘟病 Pita 基因特异引物对Pita 基因第二编码区功能位点区段进行 PCR 扩增及测序分析。研究表明,91 份贵州地方水稻均持有抗稻瘟病 Pita 基因,DNA 序列存在 6 个变异位点,氨基酸序列存在 4 个变异位点,归为 7 种 DNA 单倍型和 5 种蛋白型,其中 Pita-H1 (63.74%)、Pita-H2 (18.68%)的频率较高,是贵州的优势单倍型,其他单倍型频率较低。携带 Pita 抗性基因(编码区第 2 752 位功能位点碱基为G)的品种仅 6 个,占供试材料的 6.59%,且与越南抗性品种 Tetep 序列一致。Pita 抗性基因在贵州省广泛分布不平衡,且频率较低。本研究为挖掘和利用贵州地方稻种的抗稻瘟病基因资源提供了参考。

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