白芨转录组特性分析

白芨(Bletilla striata)具有较高的药用、经济和观赏价值，但是其基因组和转录组序列未知，严重影响了其的研究开发和利用。本研究采用His4000测序平台对白芨的全株进行了转录组测序分析，共获得原始数据6.8G，有效数据6.7G， 243410条Unigene，经过与NR、GO、KOG及 KEGG等数据库进行比较分析后，83541条Unigene被注释到NR数据库，50178条Unigene被注释到GO数据库，10007条Unigene被注释到KOG数据库，43637条Unigene被注释到Swissprot数据库，15321条被注释到KEGG代谢途径中，2021条Unigene参与了糖类代谢，1309条Unigene参与了氨基酸合成和代谢，120条Unigene 参与了萜类合成，106条转录因子与代谢相关；微卫星位点有31958个，其中单核苷酸最多，15709个，占49.16%，其次为二核苷酸和三核苷酸，分别有9145和7104个，占28.62%和22.23%。本研究为白芨的重要功能基因挖掘、遗传育种及其研究开发提供了参考和依据。