基于DNA测序技术对基因组DNA混合池在SSR引物筛选中的可靠性研究

SSR-PCR产物的重测序是SSR标记技术开发和应用的必要步骤。本研究以6个桉树DNA样品为对照组，1个基因组DNA混合池为试验组进行基因组DNA混合池在SSR引物筛选中的可靠性性分析。通过SSR-PCR产物的重测序分析，6个桉树单一DNA样品与基因组DNA混合池的扩增序列比对结果分析显示，两种模板扩增结果差异不显著，即基因组DNA混合池可以替代多个单一DNA样品进行SSR引物的高效筛选。利用20对SSR引物在6种桉树DNA样品中的扩增序列进行多态性分析发现，同一位点不同桉树种间的扩增序列存在长度多态性和核苷酸多态性，从而证实了SSR序列的多态性和复杂性，为SSR标记技术在桉树遗传育种研究中的应用提供了理论依据。