芒果(Mangifera indica) ζ-胡萝卜素脱氢酶基因ZDS的克隆及生物信息学分析

以‘红玉’芒果采后96 h的果皮为材料，采用RT-PCR技术从芒果(Mangifera indica)果皮中克隆到ζ-胡萝卜素脱氢酶基因(ZDS)，其cDNA全长为1883bp，具有1710bp的开放阅读框(ORF)，编码569个氨基酸。对芒果ZDS蛋白的亲水/疏水性进行预测，发现芒果ZDS蛋白所含的氨基酸亲水/疏水性主要介于+2.5～-2.6之间。通过在线软件对其进行了定位预测及二级结构和三级结构进行了预测，发现ZDS定位在叶绿体中，ZDS基因编码的蛋白质有16个螺旋，13个折叠，通过系统进化树分析发现芒果中ZDS基因编码的蛋白与柚子、甜橙、蜜柑等植物的亲缘关系比较近。