蒙古冰草WRKY转录因子基因的序列分析

WRKY转录因子是一类与植物抗逆相关的蛋白家族，通过激活植物抗逆应答基因的表达而提高其抗逆性。为挖掘蒙古冰草(Agropyron mongolicum)抗旱相关的WRKY基因，本研究在已有转录组测序数据的基础上，用PlantTFDB数据库中的Prediction和Blast对WRKY基因筛选及保守结构域分析，对筛选出的WRKY转录因子用ExPASy Proteomics Server和MEME程序预测其分子量、等电点和基序、并用MEGA7.0.7与已报道具有抗旱功能的16个WRKY蛋白进行多序列比对分析并构建系统进化树。结果表明：蒙古冰草中筛选出14个WRKY基因，其蛋白大小在63~677 aa范围内，分子量和等电点分别介于7.1~73.3 KD和6.09~10.09之间；基序预测得到1个特征基序，2个保守基序，最长的基序含29个氨基酸。蒙古冰草WRKY转录因子蛋白基本上比较保守，WRKYGQK没有发生变异，但存在着Q残基的变异；进化树分为两大类，一类为Unigene19129、47036、50921、其C端锌指结构是C2HC，另一大类Unigene29536、43681、52656等C端锌指为C2H2；蒙古冰草中筛选出的WRKY基因与16个具抗旱功能的WRKY基因均有同源性，推测这14个WRKY转录因子参与蒙古冰草干旱逆境下的反应。