一个全细胞计算模型从基因型预测表现型

生物探索,2012-09-21

来自哥伦比亚大学的两位科学家在7月20日Cell杂志上发表了点评文章:The Dawn of Virtual Cell Biology,指出了本期杂志上发表的一项成果为虚拟细胞生物学提出了新的希望,这项研究首次提出了一种细菌的系统动态计算机模式,其中包含了细菌的所有组成元件以及其中的相互作用。

虚拟生物学的概念其实由来已久,早在好几年前,科学家们就希望能在电脑中重建一个分子级别的生命体,这样就能了解生物体各部分如何协同工作,将可以把生物学提升到一个新的水平。到时,生物学深入了解生命就如同工程师对他们所修建的桥梁和飞机一样了如指掌了。

近期来自斯坦福大学的一群研究人员发表了题为“A Whole-Cell Computational Model Predicts Phenotype from Genotype”的文章,首次模拟了来自人类病原菌支原体(Mycoplasma genitalium)整个生命周期,提出了一个全细胞计算机模型,这一模型囊括了这个病原菌的所有分子组,以及相互作用,这将有助于促进细胞生物学的发展。

哥伦比亚大学Saeed Tavazoie教授评价道,这项研究提出了首个整合动态计算机模式,这将为系统生物学研究提供了全细胞的定量预测模型。

文献链接:A Whole-Cell Computational Model Predicts Phenotype from Genotype

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