深圳国家基因库与荷兰遗传资源中心签署合作协议

2017年10月5日，深圳国家基因库主任梅永红代表深圳国家基因库与荷兰遗传资源中心（the Centre for Genetic Resources, the Netherlands）签署关于生菜遗传变异检测与繁种项目的合作协议，双方将共同促进对于植物遗传资源在粮食和农业等方面的研究与运用。此次合作，将促进中荷双方在生物科研领域的交流与合作，并推动中国在植物遗传变异检测研究领域的发展。

根据协议，荷兰遗传资源中心将向深圳国家基因库共享所有已有的生菜种质资源。同时，深圳国家基因库也将利用其“三库两平台”的优势为数字化以及存储生菜种质资源、生菜遗传变异检测及繁种提供技术支持与保障。另外，最终所有的信息都将通过深圳国家基因库的平台免费共享给大众，真正实现深圳国家基因库对于基因资源“共有、共为、共享”的理念。深圳华大生命科学研究院的王玉博士表示，通过这次合作不仅可以优化国家基因库的种质资源，还可以通过遗传变异检测来挖掘影响生菜重要农业性状的候选基因从而优化传统的分子育种技术。“2017年4月，在来自华大和美国UC-Davis 基因组学中心等机构的科学家的共同努力下，成功解码并发表了生菜参考基因组序列”，深圳华大生命科学研究院负责植物与农业基因组的程时锋补充道，“生菜作为菊分支的重要作物之一，这次全面解读其2401份栽培和野生群体基因组，将对生菜基因组的起源和演化有一个全面的了解，并为基因组辅助分子育种以鉴定优质品系提供精准和高效的革命性途径”。

据悉，分子标记辅助选择和全基因组选择是目前主流的分子辅助育种方法，育种值的估计主要依赖于由传统基因芯片法筛选所获得的分子标记的效应。由于基因芯片技术只能筛选出已知的分子标记，所以这些分子标记无法解释所有的遗传变异，从而直接影响对目标性状表型的预测和选择，重测序的方法同时可以检测已经存在的或开发新的分子标记，从而增加了SNP的辨识度（resolution），基于这些SNP分子标记进行分子标记辅助选择或全基因组选择可以大大提高对表型预测的准确。

深圳国家基因库国际合作部门负责人Jason Chen表示，很高兴这次能跟荷兰遗传资源中心进行如此大规模的合作，这对于我们深圳国家基因库具有里程碑式的意义。接下来我们还会跟世界其他国家的相关机构进行合作，致力于为深圳国家基因库引进更多优质资源。

据了解，自从1980年第一例噬菌体碱基对得到完全测序，越来越多物种的基因组测序计划相继启动，华大在中国测序领域的贡献尤为突出。2016年，华大参与了高质量生菜参考基因组的组装工作，从而成功挑战由生菜复杂基因组所带来的组装等方面的技术难题，这项成果引起了荷兰遗传资源中心植物学家的高度关注，荷兰遗传资源中心是目前世界上存储生菜种质资源最丰富也是最完整的一个机构，其植物学家迫切希望与华大建立科研合作，并基于生菜参考基因组来构建高精度的遗传连锁图谱，同时借助全基因组重测序技术发现新的遗传变异，从而进一步研究欧洲生菜群体多样性以及遗传进化史，并且借助连锁以及关联分析挖掘影响生菜目标性状的候选基因。

关于荷兰遗传资源中心

荷兰遗传资源中心（CGN）是荷兰政府的科研职能部门，对遗传多样性和鉴定农林重要物种开展相关的科学研究。同时，CGN也是DLO基金会内协助政府完成其职能的独立科研机构。CGN致力于非原生境保护、原生境保护、以及促进遗传繁殖材料的使用以支持科研与育种并使其成为生物文化遗产的一部分。此外，CGN也向荷兰政府和国际组织提供政策支持，项目涉及农林作物与家禽、家畜等。