Science:无油樟基因组对科学家研究世界各地开花植物基因系谱意

本期由三篇文章是关于被子植物无油樟开花的完整基因测序研究,由Keith Adams总结出的一篇文章来凸显无油樟基因组对研究人员研究世界各地开花植物基因系谱的功用。相关文章发表于2013年12月20日的《science》杂志上。


无油樟花 来源:Sangtee Kim

据科学家们报告,代表最古老开花植物世系——一种有着乳白色花的小灌木——的单一物种的基因组序列终于被找到了,这让人们对开花植物是如何演化的提供了关键性的见解。

研究当今地球上植物多样化的进化生物学家对无油樟(Amborella trichopoda)——该植物代表了被子植物系谱的第一个分支——感到特别着谜;这种带有花瓣的植物给所有开花植物(而不是像那些——如裸子植物——缺乏花瓣及其它被子植物特异性改变的植物)的演化铺平了道路。

事实上,对无油樟DNA的分析一再地显示它位于或接近于开花植物系谱的基底部,但科学家们一直缺乏其完整的基因组序列——这是一种可通过与更多现代开花植物的基因组进行比较而帮助解释演化是如何影响我们当今所见的不同开花植物基因组的工具。

现在,据3项相关报告中的一篇指出,一组国际性的被称作无油樟基因组计划的作者首次提供了无油樟核基因组的综合序列。这使得这些科学家能够确定作为基本开花植物工具箱基础的基因;该小组发现了具有这种花卉祖先版本特异性的基因,它们中有许多与那些不开花植物的基因不同,从而提示这些特定的基因可能帮助了开花植物成功地实现了多样化。

在第二则报告中,Danny W. Rice等人聚焦于无油樟的线粒体DNA,这是在该植物内的一个不同的基因组,它常常会比核DNA有着较少的改变。Rice及他的团队介绍了无油樟完整的线粒体基因组并显示,其很大部分是通过与其它生物——包括苔藓和绿藻——的水平基因转移而获得的。这些生物体可能在数百万年前生活在与无油樟密切相关的地方,而文章的作者假设,线粒体基因组的融合是植物受伤的某种结果。

最后,Srikar Chamala等人解释了一种荧光原位杂交技术是如何能够对这一大型、困难的植物基因组进行下一世代测序的。由Keith Adams撰写的一则《观点栏目》提供了额外的见解,凸显了无油樟基因组对研究人员研究世界各地开花植物基因系谱的功用。

原文链接:The Amborella Genome and the Evolution of Flowering Plants

;