稻瘟病菌中HOPS复合体生物信息学分析及MoYpt7在Movps41突变体中的定位分析
发表日期:2017-05-23 09:28PM 阅览次数:
据报道,酵母中HOPS蛋白复合体参与囊泡融合及运输。本研究分别以酿酒酵母HOPS蛋白复合体各亚基氨基酸序列,通过BLASTp在稻瘟病菌数据库中搜索得到了6个酿酒酵母HOPS蛋白复合体各亚基的同源蛋白,我们通过生物信息学方法对稻瘟病菌6个HOPS复合体亚基的同源蛋白的理化特性、蛋白质结构域和进化关系进行了分析。基于稻瘟病菌98-06菌丝阶段和孢子侵染水稻CO39不同阶段转录组测序数据,分别选取稻瘟病菌内吞和外泌途径相关的基因,制作了表达模式图。此外,MoYpt7蛋白在其假定下游效应因子ΔMovps41突变体中的定位研究表明MoVps41可能影响了液泡融合。