蓝细菌通过CRISPR干扰(CRISPRi)调控琥珀酸生产

蓝细菌PCC
7942具有生化转化的能力,但是如果通过PCC 7942的基因敲除来达到生化转化的目的会非常耗时,并且可能导致细胞死亡。CRISPR干扰(CRISPRi)作为一种新兴技术,利用无切割活性的Cas9(dCas9)和靶向gRNA(sgRNA)来调控特定基因的表达,而无需基因敲除。

使用CRISPRi来处理PCC
7942中的基因网络,将靶向不同区域的黄色荧光蛋白(EYFP),dCas9和sgRNA整合到PCC 7942染色体上(图1)。dCas9和sgRNA的共表达抑制EYFP产生的效率超过99%,而且不会损害细胞生长。接下来将dCas9和sgRNA整合到糖原积累必需的内源基因(glgc)上和琥珀酸转化为富马酸所必需的内源基因(sdhA和sdhB)上。根据sgRNA结合位点,glgc,sdhA和sdhB的转录水平被有效地抑制。最终,glgc的靶向抑制将表达降低至6.2%,糖原积累减少至4.8%,显著提高了琥珀酸滴度。靶向sdhA或sdhB也有效地抑制了基因表达,并将琥珀酸滴度提高约12.5倍,已经达到了0.58-0.63mg/
L。

这些数据表明,CRISPRi介导的基因抑制允许重新导向细胞碳流,从而为PCC
7942的代谢途径的微调开拓了新途径。

文章成功利用了CRISPRi技术对蓝细菌PCC 7942相关基因表达进行了调控。通过合适的sgRNA设计,能够选择性地降低外源性报道基因(EYFP)和内源基因(glgc,sdhA和
sdhB)表达,有目标的抑制参与琥珀酸合成的内源性基因的表达,从而增加了琥珀酸产量,而且,产物滴度与基因抑制程度呈正相关。

图1 在PCC
7942中构建的CRISPR体系

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