数据库技术在育种中的应用

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基因序列、分子标记、性状表现型和环境等数据都异常庞大,来自不同的地点和生长季,如何有效地管理这些复杂的数据集,将变成将来育种的关键。美国已经建立了比较完善的玉米基因序列和遗传信息数据,这些数据库对育种家研究不同性状的遗传机制和改良玉米自交系有极大帮助,下面简要介绍与玉米直接相关的3大数据库。

MaizeGDB(http://www.maizegdb.org/)数据库提供十分丰富的遗传和基因组信息,包括遗传图谱、基因序列、QTL、等位基因等。比如,你需要了解一个玉米的基因详细信息,就可以直接在线检索MaizeGDB数据库,检索的结果中有许多有用的交叉链接。

玉米基因组测序项目(Maize Genome Sequencing Project)完成的玉米基因组序列存储在 MaizeSequence(http://www.maizesequence.org/)数据库。研究人员可以用该数据库在线查询玉米自交系B73的基因序列。

GRAMENE(http://www.gramene.org/)数据库包括禾谷类作物(比如水稻、玉米、高粱、大麦、小麦、燕麦和黑麦)的基因组。由于这些物种之间的亲缘较近,基因组之间存在很多相似性,通过研究一个物种的基因、基因调控路径和表现型,可以应用到其它近缘物种。

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