大豆SNP分型方法的比较

本研究采用测序法、酶切扩增多态性序列法(CAPS）和竞争性等位基因特异性PCR（KASP）法对大豆Dt1基因的4个SNP进行分型，旨在从准确性、稳定性、耗时和成本4个角度，对上述3种分型方法进行比较。结果表明：3种SNP分型方法均可对大豆Dt1基因进行分型，但准确性存在差异，测序法的准确率最高（100%），其次为KASP法（94.3%），CAPS法较低（89.6%）；从稳定性来看，测序法最稳定，KASP法次之，CAPS法最差；从耗时来看，KASP最省时，其次是测序法，CAPS最耗时；在成本上，相比其他两种方法，KASP法最经济。在具备相关仪器设备的条件下，KASP是大豆快速、高效的SNP分型方法。